• 2025-11-28
    本篇文章来源于微信公众号:信天翁GOONIE
  • 2025-11-28
    在分子生物学实验中,当研究人员历经艰辛从细胞中提取出珍贵的RNA后,所做的第一个关键步骤往往就是:将其溶解在DEPC水中。 此外,配制电泳缓冲液、稀释试剂乃至清洗实验器皿,都离不开它。 DEPC水可以为脆弱的RNA分子创造一个安全的环境,彻底清除无处不在的“RNA杀手”——RNase。 那么,DEPC水是如何抑制RNase的呢? 什么是DEPC水DEPC是什么? 它的中文全名是焦碳酸二乙酯,是一种非常活跃的有机化合物。在常温下,它呈无色液体状。 那么我们要如何制备呢? 研究发现0.1%的DEPC即可起到抑制RNase的作用。 将0.1%(v/v)的DEPC加入水中。即比如在水中加入1mL的DEPC制备成1000mL的DEPC水,就可以制备DEPC水。 DEPC呈有机物状态,加入水中以后,无法与水马上相溶,需要充分混合。 通常可以用电动搅拌仪和搅拌子在室温搅拌数小时或过夜,让DEPC与水相溶,与潜在RNase充分反应。 最后,有一个至关重要的步骤:必须通过高温高压灭菌处理,以去除水中未反应的DEPC。因为DEPC本身也会破坏后续...
  • 2025-11-28
    简单来说,动物组织的标准流程之所以能“先加裂解液后研磨”,是因为动物组织比植物组织“友好”得多。 植物细胞有坚硬的细胞壁植物细胞有坚固的纤维素细胞壁,物理上非常坚韧,需要极强的机械力(如液氮冷冻脆化后研磨)才能有效破碎。 动物细胞只有柔韧的细胞膜,没有细胞壁。在裂解液(通常含有去污剂如SDS)中,细胞膜会迅速被溶解。因此,对于小块动物组织,仅靠涡旋、匀浆器或珠磨的轻微机械力就足以完成破碎。 RNase含量和分布的差异植物组织:RNase不仅含量高,而且常储存在独立的区室中,如液泡、细胞壁。一旦机械破碎不彻底,这些区室破裂会持续释放RNase,而裂解液渗透需要时间,这就造成了RNA降解的“时间窗口”。 动物组织:而常用的实验组织(如肝、脑、肌肉等)本身的RNase活性相对较低。动物细胞的RNase没有储存在类似植物液泡那样坚固的区室里。当裂解液接触到组织时,它能更快、更均匀地渗透并失活所有RNase。 植物组织先液氮冷冻研磨,后加裂解液,主要是为了在裂解细胞、释放RNA之前,最大限度地抑制RNA酶(RNase)的活...
  • 2025-11-28
    有多少人感觉病毒包装就是一个玄学,为啥别人次次成功,而自己做经常滴度低,感染效率不理想? 首先让我们看看影响病毒包装的因素 病毒载体的选择慢病毒优点:它能把自己带的基因敲入细胞的基因组里,变成细胞基因组DNA的一部分。只要这个细胞活着并且分裂,外源的DNA就能一直表达下去。所以适合需要长期、稳定做研究的实验。 包装周期相对短点。 缺点:① 感染细胞的效率没那么高;② 它自己不能“繁殖”,所以病毒产量低、浓度(滴度)也低,通常需要先体外实验,不太够直接做动物注射。 腺病毒优点:感染效率高!而且纯化后能直接注射到动物体内。它还能体外“扩增”,一次能拿到很高浓度的病毒。 缺点:它不进基因组,只在细胞质里暂存,过一阵子就被细胞清除了。所以是短期(瞬时) 表达。 包装周期更长。 简单总结: 想做稳定细胞株,长期观察基因功能?选慢病毒。 想快速在体外或动物体内看到短期、强烈的效果?选腺病毒。病毒包装的步骤包装病毒是个精细活,成功与否取决于一串“流水线”上的每个环节: 细胞状态:用来包装病毒的“工厂”细胞必须健康。...
  • 2025-11-28
    ddH₂O(双蒸水)定义:经过两次蒸馏得到的纯度很高的水。 特点:不含离子、杂质和有机物,但可能含有RNase(核糖核酸酶)。 风险:RNase非常稳定,无处不在(皮肤、灰尘、器皿上都有),它会降解RNA。 DEPC水属于RNase-Free Water定义:用DEPC(焦碳酸二乙酯)处理过的ddH₂O。 特点:不含RNase,DEPC能与RNase的活性基团反应,从而灭活RNase。 注意:DEPC本身有毒性,且会干扰生化反应。因此,商业购买的或自行处理的DEPC水,在灭活RNase后,必须通过高温高压灭菌来分解残留的DEPC,才能安全使用。 稀释cDNA用那一种水?建议用DEPC水 从RNA提取、反转录到qPCR,都应该在无RNase的环境中进行。使用DEPC水可以最大限度地避免意外引入RNase。 qPCR体系配制用哪一种水?建议用DEPC水 一方面,商业化的qPCR Mix都是无核酸酶的。用DEPC水去稀释和配制体系,能保证整个反应环境的纯洁,避免因水质问题导致酶失活或非特异性扩增。 另一方面,引物(尤其是基因特异性引物)是单链DNA寡...
  • 2025-11-28
    简短的回答是:是的,需要确保质粒无菌。但是其实使用商业化的试剂盒,并不需要特意保证无菌环境,只要确保最后的洗脱液和ep管干净,就不会污染细胞。 为什么在普通实验台上操作,最终质粒却不污染细胞?01纯化柱可以去杂质质粒提取试剂盒(特别是无内毒素质粒提取试剂盒)的核心是吸附柱。在结合和洗涤步骤中,缓冲液的设计使得只有质粒DNA能高效地结合到膜上,其他蛋白质、代谢物、盐离子等杂质会被洗掉。 细菌碎片和内毒素在这些步骤中也被有效地去除了。 即使你在有菌环境下裂解细菌,这些污染物也不会被纯化柱捕获,而是在弃去的滤液和洗涤液中。 02乙醇洗脱虽然裂解、中和等前期步骤在非无菌环境下进行,但通常会用含有70%-80%乙醇的洗液洗涤。这个过程能进一步去除盐分和杂质,并且乙醇本身就有杀菌作用。洗涤后,可以保证最终收集到的质粒溶液是无菌的。 03耗材和溶菌液无菌经过前面一系列的洗涤纯化,纯化柱的膜上基本已经不含有其他杂质,接下来只要保证洗脱过程中的洗脱液和接触的耗材是干净的,提取的质粒就是无菌的。 好物推荐本篇文章来源于微信公众...
  • 2025-11-28
    PD-1 /PD-L1是重要的免疫负调控分子,在生物体中负责维持免疫耐受,及时抑制免疫效应,防止免疫系统过度激活而攻击自身正常组织。 而在肿瘤免疫学研究领域,程序性死亡蛋白-1(PD-1)及其配体(PD-L1)组成的免疫检查点通路已成为调控T细胞应答的关键机制,直接破坏肿瘤的免疫逃逸机制。 PD-1和PD-L1简要介绍PD-1PD-1(Programmed cell death protein 1 ,CD279) 是一种关键的免疫检查点受体,主要表达于活化T细胞、B细胞和NK细胞等免疫细胞的表面。 它可以促进CD4T细胞分化成调节性T细胞。PD-1的生理功能是作为免疫反应的“刹车”,和配体PD-L1或PD-L2结合时,通过传递抑制性信号,限制免疫细胞的活化和功能,从而防止自身免疫反应并维持免疫耐受。 PD-L1PDL1 (Programmed Cell Death-Ligand 1,CD274)有多个结构域,是一种含有290个氨基酸的1型跨膜蛋白。PDL1被认为是PD1的主要受体, 可以通过顺式和反式和受体 PD1 结合,从而抑制抗肿瘤的 PD1+的T 细胞功能。在抗原呈递细胞、活化的T细胞以及...
  • 2025-11-28
    本篇文章来源于微信公众号:信天翁GOONIE
  • 2025-11-28
    microRNA,也就是miRNA,是一类内源性的非编码小RNA分子,成熟的miRNA长度通常是21-23个核苷酸。它可以跟mRNA的3'UTR结合,抑制目的mRNA转录,或者导致它降解。 不过也有报道说有的miRNA会跟5'UTR相互作用。在动物体内,单个miRNA可识别多个mRNA靶标,一个mRNA靶标也可以被多个 miRNA识别,这个特性使得miRNA的研究极具困难。 miRNA在细胞增殖、分化、凋亡等多种生物学过程中扮演重要角色,miRNA表达异常与多种人类疾病的发生发展密切相关。 miRNA由来miRNA的生物合成始于由基因组DNA编码的初级转录本(pri-miRNA)。该转录本先后经过细胞核内Drosha酶复合物与细胞质Dicer酶的两次切割,最终在胞质生成成熟的miRNA单链。 值得注意的是,许多miRNA位于蛋白质编码基因的内含子区,这类miRNA与其宿主基因共享启动子等调控元件和初级转录本,因此通常表现出类似的表达模式。 图片出处:Thakore P, Delany AM. miRNA-based regulation in growth plate cartilage: mechanisms, targets, an...
  • 2025-11-28
    本篇文章来源于微信公众号:信天翁GOONIE