DEPC水如何抑制RNase?怎么配?一次性总结

作者: admin
发布于: 2025-11-28 09:54
分类: 实验方案

在分子生物学实验中,当研究人员历经艰辛从细胞中提取出珍贵的RNA后,所做的第一个关键步骤往往就是:将其溶解在DEPC水中。


此外,配制电泳缓冲液、稀释试剂乃至清洗实验器皿,都离不开它。


DEPC水可以脆弱的RNA分子创造一个安全的环境,彻底清除无处不在的“RNA杀手”——RNase。


那么,DEPC水如何抑制RNase

什么是DEPC水

DEPC是什么? 它的中文全名是焦碳酸二乙酯,是一种非常活跃的有机化合物。在常温下,它呈无色液体状。

那么我们如何制备? 研究发现0.1%DEPC即可起到抑制RNase作用

将0.1%(v/v)的DEPC加入水中。比如水中加入1mL的DEPC制备1000mLDEPC就可以制备DEPC

DEPC有机物状态以后无法马上相溶需要充分混合

通常可以电动搅拌搅拌子在室温搅拌数小时或过夜,让DEPC与水相溶潜在RNase充分反应。

最后,有一个至关重要的步骤:必须通过高温高压灭菌处理,以去除水中未反应的DEPC。因为DEPC本身也会破坏后续实验中的蛋白质(如逆转录酶、聚合酶等)。进行15分钟/升的高压灭菌后可以充分灭活DEPC。

什么是RNase
RNase,即核糖核酸酶,是一类能够降解RNA分子的酶的总称。

无处不在的“破坏王”:RNase极其稳定,生命力顽强。它广泛存在于我们的皮肤、唾液、汗液、细菌和真菌中。这意味着实验操作中一个不经意的呼吸、一次徒手的接触,都可能导致RNase污染。

惊人的稳定性:许多RNase非常“耐打”,即使经过高温煮沸或变性剂处理,在条件适宜时也可能恢复部分活性很难彻底清除。

RNA实验的“天敌”:在提取、保存和操作RNA的过程中,如果RNase污染,它就会迅速地将完整的长链RNA切割成碎片,导致RNA降解

抑制原理

DEPC 可以 RNase 分子反应中心的氨基酸发生不可逆反应,从而抑制酶活性。

它与组氨酸残基的反应最强烈,但也可与赖氨酸、半胱氨酸和酪氨酸残基反应,使水中的 RNase 失活。



本篇文章来源于微信公众号:信天翁GOONIE
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