分子生物学




那么,DEPC水是如何抑制RNase的呢?
DEPC是什么? 它的中文全名是焦碳酸二乙酯,是一种非常活跃的有机化合物。在常温下,它呈无色液体状。
那么我们要如何制备呢? 研究发现0.1%的DEPC即可起到抑制RNase的作用。
将0.1%(v/v)的DEPC加入水中。即比如在水中加入1mL的DEPC制备成1000mL的DEPC水,就可以制备DEPC水。
DEPC呈有机物状态,加入水中以后,无法与水马上相溶,需要充分混合。
通常可以用电动搅拌仪和搅拌子在室温搅拌数小时或过夜,让DEPC与水相溶,与潜在RNase充分反应。
最后,有一个至关重要的步骤:必须通过高温高压灭菌处理,以去除水中未反应的DEPC。因为DEPC本身也会破坏后续实验中的蛋白质(如逆转录酶、聚合酶等)。进行15分钟/升的高压灭菌后就可以充分灭活DEPC。
无处不在的“破坏王”:RNase极其稳定,生命力顽强。它广泛存在于我们的皮肤、唾液、汗液、细菌和真菌中。这意味着实验操作中一个不经意的呼吸、一次徒手的接触,都可能导致RNase污染。
惊人的稳定性:许多RNase非常“耐打”,即使经过高温煮沸或变性剂处理,在条件适宜时也可能恢复部分活性,很难彻底清除。
RNA实验的“天敌”:在提取、保存和操作RNA的过程中,如果RNase污染,它就会迅速地将完整的长链RNA切割成碎片,导致RNA降解。
DEPC 可以和 RNase 分子反应中心的氨基酸发生不可逆反应,从而抑制酶活性。
它与组氨酸残基的反应最强烈,但也可与赖氨酸、半胱氨酸和酪氨酸残基反应,使水中的 RNase 失活。