质粒纯化柱与PCR产物纯化柱能混用吗?答案来了

作者: admin
发布于: 2025-11-28 10:52
分类: 实验方案

PCR产物纯化柱又双叒不够用了怎么办,能不用质粒纯化柱来替代使用呢?

大部分实验室的buffer和纯化柱的数量不成正比,试剂盒中buffer过多,造成纯化柱相对短缺。其实,PCR产物纯化柱和质粒纯化柱是可以混用的。尽管它们主要用途不同,但它们的结构和原理类似,且均基于硅胶膜的吸附特性 

 

分析

 让我们先来看看纯化柱的结构和原理:

纯化柱有一层硅胶膜,材质是玻璃纤维的,能够能够选择性地吸附DNA和RNA,作用类似于一块过滤器。

在高盐浓度和低pH条件下,硅胶膜能够选择性地吸附DNA和RNA。而在低盐浓度和高pH条件下,DNA和RNA则会被释放出来。

硅胶膜的表面携带有大量修饰的硅羟基,在溶液中会解离,产生负电荷。当DNA或RNA与盐离子结合后,它们会与硅胶膜表面的硅羟基形成电桥,从而被吸附在硅胶膜上,而其他物质则被洗脱掉。

在PCR纯化过程中,加入binding buffer可以降低溶液的pH值,从而让DNA容易被吸附在硅胶膜上。

所以应该要使样本在加入柱子时,所处的溶液的pH值小于7。随后,使用的washing buffer中乙醇浓度不得低于50%,通常在70%至80%之间。

最后,完成洗涤以后,进行洗脱,洗脱液可以使用去离子水或者试剂盒配的TE缓冲液。DNA比较稳定,提取后可以长期保存在-20度冰箱。


总结

 总的来说,PCR产物纯化柱和质粒纯化柱是可以混用的原因主要有三点:

1、相似的结构组成:两种类型的纯化柱通常都包含硅胶膜,其表面有大量修饰的硅羟基(Si-OH)。

2、相似的工作原理:两种纯化柱都利用硅胶膜的吸附特性来分离DNA,硅胶膜上的修饰的硅羟基与DNA或RNA形成电桥,可吸附DNA,并且可以让DNA根据不同的盐浓度和PH值进行释放,实现吸附的可逆性。

3、相似的缓冲液条件:PCR产物纯化柱和质粒纯化柱在洗脱过程中使用的缓冲液、洗脱液等相似度高,比如,洗涤液中的乙醇浓度不得低于50%,一般70%--80%之间。

都需要在一定的pH值下进行洗脱,而洗脱液中的乙醇浓度也需保持在相似的范围内。



本篇文章来源于微信公众号:信天翁GOONIE
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