分子生物学



想要研究一个基因,应该如何下手呢?
以较常见的肿瘤基因研究为例,给大家简单介绍一下主要步骤。

确定研究基因!
文献回顾与数据库搜索:通过查阅相关文献和数据库(如PubMed、TCGA、GEO等),确定在肿瘤中具有研究价值的基因A。
基因选择:优先选择未被广泛研究的基因,或者从已知研究中找到新的切入点。
基因功能预测:基于基因注释和现有研究,预测基因A可能的功能。
体外实验(细胞实验)
基因编辑:使用CRISPR-Cas9、siRNA等技术对基因A进行敲除、敲低或过表达,以观察细胞表型的变化。
表型分析:分析细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭等生物学行为的变化,并通过多种实验方法(如流式细胞仪、划痕实验、Transwell迁移实验等)进行验证。
rescue实验:为了验证表型变化是由基因A直接引起的,可以进行rescue实验,即在敲除基因A的细胞中重新导入该基因,观察表型是否恢复。
分子机制/信号通路研究
信号通路筛选:基于基因A的功能预测和已知研究,选择相关的信号通路进行筛选。
关键分子检测:通过Western Blot、qPCR等方法检测信号通路中关键分子的表达变化。
信号通路验证:使用抑制剂或激活剂干预信号通路,观察细胞表型的变化,以验证信号通路与基因A的关系。
动物实验验证
动物模型建立:选择适当的动物模型(如裸鼠),建立肿瘤模型。
基因导入:通过病毒载体、质粒注射等方式将基因A导入动物体内。
肿瘤生长观察:观察肿瘤的生长情况,并检测与基因A相关的分子机制或信号通路的变化。
临床样本验证和临床意义
临床样本收集:收集大量临床样本,包括肿瘤组织、血液等。
基因表达检测:使用qPCR、免疫组化等方法检测基因A及其下游分子的表达情况。
临床相关性分析:分析基因A的表达与肿瘤进展、复发、转移、预后等临床指标的相关性,确定其临床价值。
