分子生物学




做wb应该选什么做内参?
在Western Blot实验中,内参蛋白的选择对于实验结果的准确性和可靠性至关重要。内参蛋白通常是一些管家基因编码的蛋白,它们的表达比较相对恒定。我们可以通过观察内参蛋白的结果,来判断实验是否可信。
比如,目的蛋白没有条带,就可以看看内参基因,如果内参有条带就说明实验操作和样本是没问题的,可能是目的蛋白不表达,或者目的蛋白的抗体有问题。
比如,目的蛋白的条带很浅,但是内参蛋白条带已经很浓,说明可能是目的蛋白的表达比较少。
如果连内参蛋白都没有条带,就可能是实验操作有问题,比如转膜失败了,或者样本降解了。
内参蛋白的选择原则:
1.蛋白表达的稳定性:通常选择恒定表达的管家基因编码的蛋白,它们一般不会因为细胞的衰老、加药、基因敲除或者环境改变等问题影响表达。
2.分子量差异:内参蛋白的分子量不能跟目标蛋白的分子量太接近,否则可能会重叠在一起无法分辨。
3.细胞定位匹配:内参蛋白的亚细胞定位需要跟目标蛋白一致。例如,如果目标蛋白位于细胞核,应选择核蛋白内参(如Histone H3或Lamin B);如果目标蛋白位于细胞质,可选择β-actin或GAPDH。
常见内参蛋白的大小跟应用场景
内参蛋白 |
分子量 (kDa) |
适用场景 |
β-actin |
42 |
全细胞、细胞质蛋白 |
GAPDH |
36 |
全细胞、细胞质蛋白 |
β-tubulin |
55 |
全细胞、细胞质蛋白 |
α-tubulin |
50 |
全细胞、细胞质蛋白 |
Histone H3 |
15 |
核蛋白 |
Lamin B1 |
67 |
核蛋白 |
COX IV |
17 |
线粒体蛋白 |
Hsp60 |
60 |
线粒体蛋白 |
Na/K ATPase |
110 |
膜蛋白 |
VDAC1 |
30 |
线粒体蛋白 |
注意事项:
如果样本涉及缺氧、糖尿病等条件下,不适合使用GAPDH作为内参
做凋亡实验的样本不适合使用Lamin作为内参
在处理血浆、乳汁、血清等样本时,因为它们不含完整的细胞结构,应选用分泌蛋白作为内参。

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