分子生物学



当然了NCBI也是可以查询到蛋白质序列的,但是我们今天给大家介绍另一个数据库Uniprot

在搜索框输入需要的目的蛋白的名字检索,以PDL1为例。结果会显示相近的所有结果,这个数据库主要以小鼠和人的蛋白为主。

我们可以选择人的PDL1,点击entry下面的号码。

近入详情页,Q9NZQ7也就是我们刚刚点击的号码,这是在这个数据库里PDL1这个蛋白对应的编码,类似他的身份证号码。对于名字相近的蛋白,我们都可以以这个号码为准,用来判断两个蛋白是否为同一个蛋白。这里还可以看到这个蛋白对应的gene symbol是CD274,他的长度是290个氨基酸。

在function栏可以查看蛋白的功能

基因和蛋白的各种别名

这里还有一个比较有用的功能,可以查看蛋白的亚细胞定位,比如PDL1,我们可以看到它是一个膜蛋白,是单次跨膜的蛋白,在细胞核也有表达。

继续往下面看,expression表达一栏,可以看到这个蛋白一些已经报道的表达部位。

接下来就到了我们标题的重点,蛋白序列的查看。选择sequence and isoforms。这里会显示这个蛋白有多少种isoforms,以及他的完整的氨基酸序列。

而且他已经贴心地标好了氨基酸的排列位点,需要第几位开始的氨基酸序列可以很快地找到,复制的时候也不会复制到上面的辅助数字,可以很快的选择需要的氨基酸序列进行复制。
