分子生物学




之前一期,我们介绍过,提取出的RNA浓度在哪些范围比较合适。


经常有一些小伙伴在后台问,提取出的RNA浓度很低,还能不能往下做逆转录和qPCR,今天给大家介绍一下。
为什么提取出的RNA浓度低?
以传统的trizol法提取为例,当RNA提取浓度低于预期(<20 ng/μL),建议从以下三方面排查:
1、样本因素
起始材料不足
穿刺组织、单细胞、体液游离 RNA 等样本因生物量低导致浓度不足,建议增加样本量或采用微量提取试剂盒。
样本降解风险
坏死组织、离体超 2 小时的样本内源 RNase 活性高,需取材后立即用 RNA 保护剂处理或液氮冻存。
2、操作因素
裂解不充分
肌肉、纤维组织等结构坚韧,常规研磨难以彻底破碎细胞,导致 RNA 释放不充分。需延长研磨时间,或采用机械研磨结合强效裂解液的方式。
沉淀不完全
乙醇沉淀时温度、时间不足,会降低 RNA 回收率,应确保在 - 20℃沉淀足够时间。
洗脱体积不当
洗脱体积过大直接稀释 RNA 浓度,推荐使用20- 30 μL 无酶水洗脱。
3、污染
耗材污染
普通塑料耗材表面可能残留 RNase,未经 DEPC 处理的水、枪头,RNase 活性可在 30 分钟内降解 90% 以上的 RNA。所有耗材必须为RNase - free。
操作污染
人体皮肤、唾液中富含 RNase,操作时未佩戴手套、频繁交谈,会引入外源 RNase。实验全程需佩戴无粉乳胶手套,且避免手套接触非实验物品;操作台用 75% 乙醇擦拭清洁。
4、储存不当
温度影响
4℃短期储存时间过长,RNA 会因水分子作用缓慢降解;-20℃长期储存若反复冻融(超过 3 次),RNA 断裂率增加 50%。
分装方式
未分装的 RNA 样本,每次开盖都会引入湿气与氧气,加速 RNA 氧化降解。建议根据实验用量精确分装,减少样本暴露次数。
关键提示:浓度低不等于质量差!通过以下指标验证
Nanodrop:A260/A280=2.0(无蛋白/溶剂污染)
电泳:28S/18S条带清晰
当浓度偏低时,若 A260/A280 在2.0 左右且电泳条带完整,仍可用于 qPCR 等对完整性要求高的实验,无需重复提取。
2025-06-28

2025-06-13

2025-06-01

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