RNAflash™ 细胞直扩一步法 RT-qpcr (SYBR Green) kit
无需额外提取RNA和逆转录
10个细胞可直接测qPCR
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Ct值稳定,复孔间重复性好
货号:500-103
一、产品保存:
-15℃至-25℃保存一年,干冰运输。
二、 产品简介:
RNAflashTM DCA(Direct Cellular Amplification)one step RT qPCR (SYBR Green)kit 是一款快速、高效地从 “细胞”直接到“扩增结果”的 全套试剂盒,适用于 10 - 105 个培养细胞的基因表达分析。本产品无需传统提取繁琐的流程,可在细胞培养板中直接完成基因组 DNA 清除和 RNA 获取;搭配高效率、高稳定性、高特异性的一步法染料法 RT-qPCR 试剂,快至 52 min 即可从细胞中得到基因表达结果。本试剂盒操作便捷,可兼容广泛的细胞类型(贴壁和悬浮细胞)及细胞量,在提高效率的同时减少纯化过程中的样品损失,也可解决传统提取方式中低细胞数提取效果不佳的问题。本试剂盒可用于高通量(96/384 孔板)细胞 RNA 的表达分析。
三、产品特点:
普适性:多种细胞类型的基因表达分析,从 10个到 10⁵个常规培养细胞或稀有细胞,均可实现有效检测;
免纯化工艺:简化传统 RNA 提取流程,在培养孔内 5 分钟完成细胞裂解,7 分钟内完成 gDNA 消化,避免纯化造成的 RNA 损失;
高通量兼容:满足大规模细胞样本的平行处理需求,显著降低了高通量检测过程中的时间成本以及操作误差;
高效率:优化的一步法 RTqPCR 体系兼容裂解体系,最快检测仅需 52min。
四、产品组成:
货号 | 组分 | 规格(100T/20 μL) | 说明 | 储存条件 |
500-103-1 | Lyse™ Buffer (a) | 5000µL/支 | 裂解缓冲液 | 融解置于2-8℃ |
500-103-2 | Purge™ Enzyme | 200µL/支 | 基因组去除酶 | -20℃ |
500-103-3 | StopXtract™ Buffer (b) | 500µL/支 | 终止缓冲液 | 分装置于-20℃ |
500-103-4 | DCA One-Step RT-qPCR Enzyme Mix | 100µL/支 | 酶混合液 | -20℃ |
500-103-5 | DCA One-Step RT-qPCR Buffer Mix(c) | 1000µL/支 | 缓冲液混合液 | -20℃ |
- Lyse™ Buffer解冻后可于2~ 8℃条件下稳定存放1年。
- StopXtract™Buffer应避免反复冻融,需分装后置于-20℃。
- DCAOne-Step RT-qPCR Buffer Mix含dNTP Mix,Mg2+,热启动Taq酶、逆转录酶和荧光染料等,该组分在拆包装后需避光保存。
五、自备材料和试剂
ROX 校正染料, 1 × PBS 缓冲液、RNase-free ddH2O、RNase-free 吸头、1.5 ml RNase-free 离心管、0.2 ml RNase-free 八联排/PCR 管等。
六、实验工作流程图
七、实验流程
RNA获取
1、样本处理与准备
①贴壁细胞:
- 洗涤细胞:将不同孔板的贴壁细胞轻轻去除细胞培养基后,贴壁缓慢加入与培养基等体积的预冷的1×PBS洗涤,用移液器轻轻吸打8 - 10次,无明显细胞团即可;转移到离心管内,1000 rpm (930×g) ,4℃离心5 min收集至管底,缓慢去除PBS。 注意:去除培养基或PBS时动作应尽量轻缓,避免在清洗过程中造成细胞损失。
- 稀释细胞:根据实验需求(细胞数量测试的线性范围为10至105个),用预冷的1 × PBS稀释细胞,将 稀释后的细胞悬液分装至200μL PCR管中,每管5 μL (保持细胞数在10 - 10^5个/管),置于冰上备用。
②悬浮细胞:
- 去除培养基:将悬浮细胞转移至离心管中,1000 rpm (930 × g), 4℃离心5 min收集至管底, 去除培养基。
- 洗涤细胞:加入预冷的1× PBS (尽量保证细胞密度处于2 ×104至2 ×106个/mL, 500 μL/105个细胞),用移液器轻轻吸打8 - 10次,无明显细胞团即可;1000 rpm (930 × g) ,4℃离心5 min收集至管底,去除PBS。
- 稀释细胞:根据实验需求(细胞数量测试的线性范围为10至105个),用预冷的1 × PBS稀释细胞,将 稀释后的细胞悬液分装至200μL PCR管中,每管5 μL (保持细胞数在10 - 10^5个/管),置于冰上备用。
注意:去除培养基或PBS时动作应尽量轻缓,避免在清洗过程中造成细胞损失。
RNA获取
配制裂解工作液(200μL PCR管)
组份 | 体积(μL) |
Lyse™ Buffer | 48 |
Purge™ Enzyme | 2 |
注意:裂解工作液按照孔板所需体积进行配制,各组分的比例为Lyse™ Buffer : DNase I : Purge™ Enzyme = 24 : 1。 配制完毕,颠倒混匀10 - 15次,避免剧烈涡旋振荡;混匀后置于冰上,请在1 h内使用。
- 向含有5μL细胞液的200 μL PCR管中加入50 μL裂解工作液,移液器轻轻吸打8 - 10次充分混匀,室温静置5 min 裂解细胞。
- 加入5 μL StopXtract™ Buffer,移液器轻轻吸打8 - 10次混匀,室温静置2 min终止反应。
注意:裂解产物可直接用于后续实验,如逆转录、一步法RT-qPCR及RT-PCR等。 裂解产物可置于冰上保存2 h,若需长期保存需置于-80℃。
一步法RTqPCR反应
配置反应体系
按下表 1 在冰上配制反应体系
试剂 | 单个反应体积(μL)(1 ) |
DCA One-Step RT-qPCR Enzyme Mix | 1 |
DCA One-Step RT-qPCR Buffer Mix | 10 |
10 µM 靶标上游引物(2,3,4) | 0.4 |
10 µM 靶标下游引物 | 0.4 |
细胞裂解液 | X(参考步骤 7.2.2) |
ROX 校正染料(5) | Y |
RNase-Free/DNase-Free 水 | Up to 20 μL |
注意:
- 将各组分置于冰上融解,轻微混匀离心后,加液顺序按照体系从多到少。
- 一般来说反应体系中引物终浓度为2μM 即可得到较好的扩增效果。当反应性能比较差时,可以在 0.1 - 1.0 μM 范围内调整引物浓度。
- 可根据检测需要,增加靶标个数。
- 扩增产物长度请选择在 100- 500 bp 范围内,尤其推荐 100 - 200 bp 之内。
- 若使用需要校正染料的 qPCR仪,则按照注意事项中建议的浓度投入到体系。
模板投入
向实验组的 PCR 反应管中分别加入 2-8 μL 细胞裂解液,使用 5 μL RNase-Free/ Nuclease Free H2O 作为无模板对照 (NTC 组),每组设置 3 个重复。
注意:投入 2-8μL 细胞裂解液,对扩增无抑制作用,细胞裂解液投入体积尽量不要低于 1 μL,避免吸液不准造成的误差。
反应程序
将反应体系轻轻混匀,并短暂离心,随后运行表 2 程序。
步骤 | 循环数 | 反应温度 | 反应时间 | 收集信号 |
逆转录(5) | 1 cycle | 50℃ | 3 min | 否 |
预变性 | 1 cycle | 95℃ | 30 sec | 否 |
变性 | 40 cycle |
95℃ | 10 sec | 否 |
延伸 | 60℃ | 30 sec | 是 |
注意:5. 对于具有复杂二级结构或高 GC 区域的模板,将逆转录温度提高到 55℃,有助于提高扩增效率和灵敏度。逆转录时间可延长至 15 min,有助于提高 cDNA 产量。
No RT Control 反应(可选)
No RT Control 是指不加逆转录酶的逆转录阴性对照反应,用于检验 RNA 模板中是否有基因组 DNA残留。也可使用 Fast Taq SYBR Green qPCR Mix(货号 500-102)进行检测。
注意事项
- 按照注明的储存条件和要求对试剂储存,比如为避免StopXtract™ Buffer反复冻融,应对其分装后置于-20℃。
- 裂解细胞时,吹打时尽量轻柔,避免剧烈起泡。
- 一步法RT-qPCR(染料法)酶反应液含有高浓度的甘油,使用前请短暂离心,收集到反应管底部,并用移液枪轻轻吸打,充分混匀后准确吸取。
- 反应液的配制请使用RNase-free枪头,EP管等,尽量避免污染。
- 本制品中未配有ROXReference Dye,如果反应中需要添加ROX Reference Dye用以校正孔间荧光信号值误差,请根据仪器设备说明书要求确定是否添加ROX Reference Dye(一般需要高浓度ROX校正的仪器的ROX工作浓 度为4 μM;需要低浓度ROX校正的工作浓度为0.08 μM ,仪器见表3),ROX Reference Dye 产品在反应体系中建议50X稀释使用(例如,50μl反应体系中添加1μl ROX Reference Dye),如果实验结果不理想,可调整ROX Reference Dye添加量。
仪器 | |
无需添加ROX |
(Bio-Rad) IQ5, CFX96, CFX384, CFX Connect, MJOpticon, Opticon 2; (Cepheid) SmartCycler®System, Smart Cycler II System;(Roche) LightCycler®2.0, 480, 96;(Qiagen) Rotor-Gene Q, 3000, 6000; (Bioer) Line-Gene;(Eppendorf) Mastercycler ep realplex; (Analytik Jena) qTOWER3; |
添加ROX(终浓度为0.4μM) | (Thermo) ABI7000, 7300, 7700, 7900, 7900HT, 7900HT Fast, StepOne, StepOnePlus |
添加ROX(终浓度为0.08μM) |
(Thermo) ABI 7500, 7500 Fast, ViiA7, QuantStudio 3 / 5, QuantStudio 6 / 7 / 12K Flex, QuantStudioTMDx;(Agilent) Mx3000P, Mx3005P, MX4000; |